劉裕擊桓玄之戰

劉裕進入建康城後，將各種重要的事情，全部都委托給劉穆之，他處理事情又快速又穩妥，劉裕因此把他當成心腹，大事小事都要向他咨詢，劉穆之也竭盡全力地輔佐劉裕，沒有一點遺漏和隱瞞。

當時晉朝的政治，沒有綱紀和法律，豪門貴族仗勢欺人，百姓窮困窘迫，加上司馬元顯的政令簡直是違背天理，桓玄雖然想厘正管理，但是科目條陳又太過繁雜細密，眾人無法適應。劉穆之針對當時的實際情況加以矯正，在劉裕的以身示范之下，百官都盡忠職守，不過十餘天的時間，民風馬上就改變瞭。

劉裕起兵之前，諸葛長民到豫州時，已經誤瞭約定的時間，不能發兵，刁逵抓住諸葛長民，用囚車押送給桓玄。囚車行進到瞭當利時，桓玄已經失敗瞭，押送囚車的人打破瞭囚車，放走諸葛長民，他回到瞭歷陽。

刁逵見勢不妙，棄城而走，被他的部下抓住，在石頭城被斬首，他的子侄親屬全部被處死。刁逵的舊臣將他的侄子刁雍藏起來，暗地裡送到洛陽，投奔瞭後秦，被姚興任命為太子中庶子。